زمانی که اطلاعاتی از یک پرایمر در اختیار ندارید و تنها به توالی آن دسترسی دارید به کمک این سایت می توانید اطلاعات مربوط به Tm، محتوی GC%، و سایر پارامترهای مورد نیاز که مربوط به ویژگی یک پرایمر است را در این پرایمر بررسی نمایید.
ابتدا وارد سایت به آدرس https://eu.idtdna.com/site شوید، در قسمت SCiTools/Oligoanalyzer tool با وارد کردن اطلاعات مربوط به شرایط واکنش PCR به آنالیز و بررسی آن پرایمر از نظر وجود ساختار های ثانویه (Hairpin)
Self dimer
hetero dimer
و Tm
بپردازید.
اطلاعات بدست آمده از این سایت پیش از گذاشتن PCR می تواند در موفقیت هر چه بیشتر آن بسیار مفید باشد.